הנקה קובעת את איכות תפקוד המעיים של התינוק בעתיד.

לדברי מומחים, חלב האם מכיל חיידקים החשובים לבריאות התינוק והם יכולים לעזור לילדים לעכל מזון בעתיד. זה לא סוד שתינוקות, מסיבות שונות שנמנעו מהנקה, סובלים לעתים קרובות מגזים. מדענים אמריקאים גילו כי ספציפיות התזונה של יילוד בחודשים הראשונים לחייו קובעת לא רק את ההרכב, אלא גם את היציבות של פלורת המעיים.

במהלך המחקר, רופאים ניתחו את הצואה, כמו גם את ספציפיות התזונה ובריאותם של תשעה ילדים בשבועיים הראשונים לחייהם. כתוצאה מכך נמצא הבדל איכותי בין המיקרופלורה במעי של תינוקות שקיבלו חלב אם בחודשי החיים הראשונים לבין אלו שקיבלו רק פורמולת חלב. מדענים מציעים כי הנקה מסוגלת להכין את מערכת העיכול של הילד לצריכה ולעיכול תקין של מזון מוצק.