המחלוקות בנוגע להשפעות ארוכות הטווח של תזונה דלת פחמימות אינן שוככות בקהילה המדעית. אם ניקח בחשבון את הירידה המהירה במשקל בפרק זמן קצר, אז דיאטות כאלה יעילות למדי. אולם יש מדענים שיש להם ספק לגבי הערך התזונתי של תזונה כזו. מומחים אפילו מתקשים לומר לאילו השלכות הרכב כזה של הדיאטה יכול להוביל.
ג'ון באקלי, פרופסור לבריאות באוניברסיטת דרום אוסטרליה, משוכנע שלפני שנותנים עצות לגבי דיאטה מסוימת, אתה צריך להבין את ההשלכות של בחירה כזו. בנוגע לתזונה דלת פחמימות, הוא קובע: הפחתת צריכת הפחמימות יכולה להוביל לרמות גבוהות יותר של "כולסטרול רע." מכאן בעיות הלב וכלי הדם.
יש להכיר בכך שרמת ה"כולסטרול הרע ", למרבה המזל, יורדת לאחר זמן מה. אבל המשקל שאבד לא נשאר ברמה שהושגה. ככלל, קילוגרמים משיגים די מהר.
מה שחמור הרבה יותר הוא האפשרות לבעיות לאורך זמן הקשורות במצב רוח, כמו דיכאון. בנוסף, סירוב לפחמימות (והמקור שלהם הוא מזון צמחי שימושי כמו דגנים מלאים, ירקות ופירות), אדם מאבד את חומרי התזונה והנוגדי חמצון הנחוצים שיש להם השפעה מועילה על הלב וכלי הדם. סיבים תזונתיים, סידן וחומצה פולית אינם זמינים בכמויות הנכונות.
